MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	CTTGT	2	10	69	78	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015670	TTAG	2	8	217	224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015670	AGT	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015670	CTAT	2	8	1530	1537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015670	ACACA	2	10	1544	1553	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015670	AACC	2	8	1573	1580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015670	CCCCAA	2	12	1873	1884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015670	GCA	2	6	2126	2131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015670	TC	3	6	2671	2676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015670	TAAA	2	8	2735	2742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015670	TCC	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015670	GTG	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015670	ATT	2	6	2860	2865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015670	A	6	6	2886	2891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015670	A	6	6	2935	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015670	CAT	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015670	CCT	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015670	CT	3	6	3229	3234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015670	C	6	6	3251	3256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_015670	ACA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015670	CT	3	6	3495	3500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015670	G	6	6	3510	3515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015670	C	6	6	3522	3527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_015670	TGG	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015670	CAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015670	CG	4	8	3694	3701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015670	T	7	7	3784	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015670	A	6	6	3886	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015670	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015670	TTGT	2	8	6091	6098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015670	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015670	AC	3	6	6123	6128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015670	TTCA	2	8	6155	6162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015670	T	6	6	9856	9861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015670	T	8	8	9908	9915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015670	A	8	8	9934	9941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015670	C	9	9	10547	10555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_015670	ATA	2	6	10572	10577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015670	A	7	7	10605	10611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015670	TAA	3	9	10813	10821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015670	TGG	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015670	A	8	8	10858	10865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015670	AACA	2	8	10886	10893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015670	AAAC	2	8	11186	11193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015670	ATG	2	6	11197	11202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015670	TGT	2	6	11249	11254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015670	A	6	6	11318	11323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015670	GA	3	6	12053	12058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015670	AGA	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015670	AAC	2	6	14922	14927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015670	AAGCA	2	10	14935	14944	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015670	TAT	2	6	14947	14952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015670	CT	3	6	14960	14965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015670	GTTTG	2	10	14977	14986	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015670	GT	3	6	15004	15009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015670	CTTC	2	8	15015	15022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015670	AGTT	2	8	15230	15237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015670	A	6	6	15267	15272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015670	TTA	2	6	15352	15357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015670	AC	3	6	16266	16271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015670	GGGC	2	8	16281	16288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015670	CAA	2	6	16300	16305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015670	ACT	2	6	16319	16324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015670	AC	3	6	16326	16331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015670	T	6	6	16344	16349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015670	TTGTA	2	10	16355	16364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015670	TG	3	6	16376	16381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015670	CAA	3	9	16400	16408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015670	ATAGA	2	10	16438	16447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015670	A	6	6	16553	16558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015670	A	7	7	17043	17049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015670	AG	4	8	17080	17087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015670	T	7	7	17112	17118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015670	AG	4	8	17136	17143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015670	TTTG	2	8	17200	17207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015670	ATTG	2	8	18450	18457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015670	TCT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015670	TTA	2	6	22624	22629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015670	CA	3	6	22638	22643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015670	T	6	6	22743	22748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015670	T	6	6	22760	22765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015670	CATGC	2	10	23768	23777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015670	CCAA	2	8	23814	23821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015670	GCTT	2	8	23832	23839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015670	GGTAGG	2	12	23885	23896	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015670	AT	3	6	23911	23916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015670	TCA	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015670	AGTT	2	8	24009	24016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015670	GTTT	2	8	24044	24051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015670	TCGG	2	8	24055	24062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015670	CT	3	6	30687	30692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015670	TG	3	6	30699	30704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015670	GAG	2	6	30961	30966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015670	TGT	2	6	31188	31193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015670	CAA	2	6	31524	31529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015670	CAT	2	6	31736	31741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015670	A	6	6	31817	31822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015670	CT	3	6	31911	31916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015670	GGCAA	2	10	33340	33349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015670	AAG	2	6	33371	33376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015670	GGGT	2	8	33393	33400	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015670	TCA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015670	AGCA	2	8	33447	33454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015670	T	6	6	33474	33479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015670	TGT	2	6	33504	33509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015670	TTGTA	2	10	33552	33561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015670	TGTGG	2	10	33580	33589	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015670	AT	3	6	33592	33597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015670	GTATG	2	10	33604	33613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015670	TAT	2	6	33620	33625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015670	AG	3	6	33688	33693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015670	TG	3	6	34671	34676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015670	TAT	2	6	36656	36661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015670	A	6	6	37218	37223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015670	GAC	2	6	40486	40491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015670	T	7	7	40509	40515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015670	ACT	2	6	40586	40591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015670	ATC	2	6	41640	41645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015670	ACC	2	6	41651	41656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015670	TC	3	6	42606	42611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015670	ACA	2	6	42689	42694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015670	AAT	2	6	42696	42701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015670	TATTG	2	10	42704	42713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015670	TATTT	2	10	42714	42723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015670	TG	3	6	42727	42732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015670	GTATT	2	10	42733	42742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015670	TGT	2	6	42764	42769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015670	CA	4	8	42775	42782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015670	ATT	2	6	43605	43610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015670	AAAAT	2	10	43635	43644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015670	ATTTTT	2	12	43663	43674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015670	TGG	2	6	43960	43965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015670	A	6	6	43973	43978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015670	TAG	2	6	43996	44001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015670	ATG	2	6	44428	44433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015670	GT	3	6	44436	44441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015670	CAA	2	6	44450	44455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015670	GTTG	2	8	48568	48575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015670	TAT	2	6	49112	49117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015670	ATTA	2	8	49125	49132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015670	ATT	2	6	49138	49143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015670	ATTA	2	8	49150	49157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015670	TTAAT	2	10	49158	49167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015670	TGA	2	6	49168	49173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015670	TATT	2	8	49188	49195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015670	ATTA	2	8	49206	49213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015670	ATT	2	6	49222	49227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015670	TAA	2	6	49229	49234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015670	ACATTA	2	12	49400	49411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_015670	ATA	2	6	49441	49446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015670	T	6	6	49462	49467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015670	A	6	6	49506	49511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015670	TGGCA	2	10	50142	50151	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015670	TG	3	6	50189	50194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015670	TG	3	6	50204	50209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015670	TAT	2	6	50278	50283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015670	ATTT	2	8	50320	50327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015670	TGT	2	6	50351	50356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015670	GAT	2	6	50436	50441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015670	CTA	2	6	50472	50477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015670	CAA	2	6	51516	51521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015670	C	7	7	51627	51633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
163	NC_015670	TTG	2	6	51694	51699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015670	AGG	2	6	51748	51753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015670	CA	3	6	51798	51803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_015670	TGAG	2	8	51825	51832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015670	GTT	2	6	51837	51842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015670	CTTGT	2	10	51925	51934	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.